粮油及产品与其他食品一样，在种植、加工、包装、储存、运输、销售等环节，都会受到各种各样的有毒有害物质污染。这些有毒有害物质的来源也是多方面的，可能来自环境污染，也可能来自生产加工过程，有的则是粮油本身存在的（如棉籽油中的游离棉酚）。粮油的污染可分为生物性污染、化学性污染和放射性污染三大类。
生物性污染：对粮油来说，主要是真菌毒素的污染。
化学性污染：这是粮油中污染面最广、污染量最大的一类污染。如：化肥、农药、兽药残留污染，环境中的或工业“三废”通过水、土、空气造成的有害元素（如铅、铬、镉、汞、砷等）和工业化学品（如多氯联苯、二噁英等）的污染，还有加工过程及包装、容器材料造成的污染等。最主要的化学污染物是农药和有害元素两类。
放射性污染：此类污染在粮油中一般不常见。
