小麦赤霉病是一种真菌病害，主要发生在麦穗上，造成整穗或部分小穗腐烂。多雨和潮湿天气下，病穗会产生粉红色霉状物，也正因为这一特征才得名赤霉病。这种病害在我国长江中下游和东北的三江平原发生十分严重。病害一方面造成枯白穗，降低千粒重，影响产量，另一方面由于病菌分泌的毒素对人体有害而限制了食用性价值，病粒率高于4%的小麦则不能收购。
要有效防治赤霉病，就要了解该病的来龙去脉。首先，小麦赤霉病病菌只能在小麦扬花、灌浆期侵染部分小花，然后扩展到整穗。真正能够引起病害的是一种叫做子囊孢子的传播体，它们是从上一年遗留下来的病残体上产生的，包括病麦穗、稻桩和玉米秸秆。其次，它是一种典型的气候型种病害。只有在小麦扬花灌浆期遇到阴雨天气，空气中又有大量病菌（子囊孢子）时，病害才可能大发生。由于年年都会存在大量的病菌，小麦抽穗至灌浆期的天气，特别是降雨量和降雨次数就决定了赤霉病发生的轻重。
防治赤霉病，一要搞好田园卫生，清除玉米、小麦秸秆，特别是小麦—玉米轮作田，一定要及早翻耕灭茬。二要加强预测，在小麦抽穗扬花期喷药保护。过去多用25%多菌灵（苯并咪唑44号）可施性粉剂每亩150克—200克，或70%甲基硫菌灵（甲基托布津）水分散粒70克—100克/亩。由于连续使用，部分地区的病菌对多菌灵产生了抗药性。最近南京农业大学的专家提出，可以使用戊唑醇和咪鲜胺与多菌灵混配或轮换使用。具体计量为：50%咪鲜胺锰盐、50%咪鲜胺锰络合物（又名施保功）1000—2000倍液、25%戊唑醇（又名立克秀）乳油2500倍液。一般掌握在小麦抽穗率到10%时喷药，如预报有雨，可抢在雨前打药。由于南方小麦抽穗扬花期经常下雨，要在晴天防治。根据当地小麦抽穗整齐程度和天气状况，有些地方要间隔7天，连续防治两次
