在水稻播种至秧田期农户要重点防治种传病害（恶苗病、苗稻瘟、干尖线虫病等）、灰飞虱、一代螟虫等。在水稻破口期要重点防治稻飞虱、稻纵卷叶螟、螟虫、穗瘟、稻曲病等病虫害。在水稻穗期以稻飞虱为主治对象，兼治其他病虫害。
一、稻飞虱防治
农户要增施有机肥，实行测土配方施肥，实行浅水勤灌，适时适度烤田。一季稻7月初前不用或少用化学农药，营造稻田天敌繁衍有利条件。
当分蘖期百丛低龄若虫1000头（褐飞虱占60%以上）-1500头（白背飞虱占60%以上），孕穗期（大肚期）至齐穗期百丛低龄若虫1500头（褐飞虱占60%以上）-2000头（白背飞虱占60%以上）；齐穗期以后百丛低龄若虫2000头时，农户可以选用吡蚜酮、噻嗪酮、乙虫腈、毒死蜱、敌敌畏等进行防治。对于虫态复杂的田块，宜选择两种对路药剂混用。在用药时要用足药量、对足水量（每亩60公斤）、喷准部位（稻株中、下部）、保持水层（3厘米左右水层5天），无水田块加大用水量或用敌敌畏熏蒸。
二、稻纵卷叶螟防治
农户要在水稻生长前期促进早发，中期适时适度烤田，后期控制氮肥使用。
在大发生年份，防治适期为卵孵高峰期，7天后再补治一次；中等发生年份，防治适期为低龄幼虫高峰期。四（2）代稻纵卷叶螟防治可选用Bt、阿维菌素等药剂（选用生物农药Bt时，防治适期应掌握在卵孵高峰期）；五（3）代和六（4）代防治可选用阿维菌素、丙溴磷、氯虫苯甲酰胺、甲维盐和毒死蜱等。
三、水稻螟虫防治
冬闲田及时翻耕灌深水并保持一周以上，适当推迟水稻播期，避开和减轻主害代的为害。合理用药，开展性诱剂、杀虫灯示范应用，以减少化学农药用量。
二化螟一代以早稻大田和一季稻秧田为重点保护对象，在卵孵高峰期选用Bt及其复配剂或在1、2龄幼虫高峰期选用杀虫单防治；二代重点防治单季稻田，防治适期在卵孵高峰期，重发区域7天到10天后再补治一次，药剂选用甲维盐、毒死蜱、氟虫腈、阿维菌素复配剂；三化螟一代结合防治二化螟，二代挑治枯心。当亩卵块密度达120块以上的田块时，在卵孵高峰期用药防治，药剂选用阿维菌素复配剂、杀虫单等；三代主治白穗，在一季稻破口期（当5-10%水稻破口露穗时）用药防治，药剂选用三唑磷与杀虫单或阿维菌素复配剂。农户特别要注意，防治过程中不同类型的农药要交替轮换使用，以延缓抗药性产生。施药时田间要尽量保持浅水层。
四、稻瘟病防治
水稻品种在连续4-5年种植后要及时更换。水稻播种前农户可以用25%咪鲜胺或5.5%二硫氰基甲烷2500-3000倍液浸种。农户要注意氮磷钾的合理配施，提倡喷施叶面肥。浅水勤灌，适时适度烤田。
在防治苗瘟和叶瘟时，发现中心病株即挑治或病叶率达3-5%时施药防治1-2次。防治穗瘟，老病区感病品种要严格做到破口前3-5天喷药预防，一周后再补治，药剂可选用40%稻瘟灵、75%三环唑、枯草芽孢杆菌、春雷霉素等。
五、水稻条纹叶枯病防治 根据粳、糯稻重于籼稻的表现特性，省植保总站建议病害偏重发生稻区压缩粳、糯稻，扩种籼稻或推广种植盐稻8号、徐稻3号、盐粳9号、皖稻119、丰两优1号、丰两优4号等抗病性较好的水稻品种。在重病区提倡使用防虫网或无纺布育秧，一季稻适当推迟播期，提倡直播，以避开一代灰飞虱成虫迁移传毒高峰。重病区小麦成熟收割期秧田普治灰飞虱，药剂选用吡蚜酮或毒死蜱、仲丁威等，并视虫情及时补治。病害常发区分别于灰飞虱第二、三代卵孵至低龄若虫盛期防治，药剂选用吡蚜酮或毒死蜱、仲丁威等。
六、稻曲病防治 农户可以选用协优系列、D优527、秀水664等抗病品种。在水稻破口前10天第一次施药，破口期再补治一次，药剂可选用戊唑醇、井?蜡蚜、井?烯唑等。
七、水稻纹枯病农药防治
农户在灌水耙田时，打捞被风吹到田边的“浪渣”，并带出田外集中处理，减少水稻纹枯病初始菌源。实行氮磷钾合理配施，适时适度烤田。
在早稻孕穗期病丛率达20%、抽穗期病丛率达40%的田块，中、晚稻分蘖至拔节期病丛率达20%的田块，要及时喷药防治，药剂可选用24%噻呋酰胺悬浮剂（满穗）、20%井冈霉素可湿性粉剂、5%井冈霉素水剂、12.5%井?蜡蚜水剂等，药液要均匀喷在稻株中下部。重病田块第一次施药后7-10天再补治一次
